L'écotoxicologie étudie les impacts écologiques de la pollution de l'environnement par les substances et les radiations d'origine humaine.
Les activités humaines, comme celles dans le secteur industriel et le secteur agroalimentaire, perturbent les écosystèmes qui nous entourent. Les substances que les humains rejettent dans l'environnement peuvent se dégrader naturellement ou bien s'accumuler et ainsi contaminer l'écosystème. L'écotoxicologie s'intéresse donc à la circulation de ces contaminants dans les écosystèmes.
L'écotoxicologie cherche également à obtenir une meilleure connaissance des contaminations et à en faire la prévention. Le risque écotoxicologique d'un contaminant se documente par le danger d'une substance, évalué par des études de toxicité, et par la probabilité d’exposition à cette substance.